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■上場■ 1社
 
<1999年9月2日>
株式会社光通信
 
■2部から所属変更■ 15社
 
<1999年9月1日>
株式会社クレディア (2007年10月15日廃止=民事再生法適用申請)
株式会社サニックス
シャディ株式会社 (2007年9月11日廃止=MRCホールディングス株式会社と株式交換)
フォスター電機株式会社
株式会社ヤマト
株式会社ラウンドワン
ローランド株式会社
株式会社ワールド (2005年11月15日廃止=株式会社ハーバーホールディングスアルファと株式交換)
株式会社データ通信システム
三洋電機クレジット株式会社 (2007年9月15日廃止=株式会社STVパートナーズがTOB)
株式会社ニッシン (2011年8月1日~2部)
株式会社富士通ビジネスシステム (2009年7月28日廃止=富士通株式会社と株式交換)
日本電子計算株式会社 (2006年9月26日廃止=株式会社JBISホールディングスに株式移転)
株式会社ナック
北沢産業株式会社
 
■2部に指定替え■ 0社
 
■上場廃止■ 3社
 
1999年9月11日 株式会社東京相和銀行=<倒産>
1999年9月23日 東洋アルミニウム株式会社=<合併・日本軽金属株式会社へ>
1999年9月24日 東京田辺製薬株式会社=<合併・三菱化学株式会社=移転・株式会社三菱ケミカルホールディングスへ>
 
■■1999年9月末上場企業■■ 1357社