| ■上場■ | 10社 |
| ＜2000年３月１日＞ | |
| 株式会社ライフ | （2000年８月20日廃止＝会社更生法適用申請） |
| 株式会社ベネッセコーポレーション | |
| 株式会社トマト銀行 | |
| 株式会社鳥取銀行 | |
| 大阪証券金融株式会社 | （2013年７月17日廃止＝日本証券金融株式会社に合併） |
| ＜2000年３月６日＞ | |
| 黒田電気株式会社 | |
| ＜2000年３月８日＞ | |
| 高砂電器産業株式会社 | （2010年12月28日廃止＝コナミ株式会社と株式交換） |
| ＜2000年３月９日＞ | |
| 船井電機株式会社 | |
| ＜2000年３月10日＞ | |
| 株式会社アドヴァン | |
| ＜2000年３月16日＞ | |
| 豊田紡織株式会社 | |
| ■２部から所属変更■ | 29社 |
| ＜2000年３月１日＞ | |
| アイフル株式会社 | |
| アイホン株式会社 | |
| アロン化成株式会社 | （2011年６月28日廃止＝東亞合成株式会社と株式交換） |
| 株式会社エイデン | （2002年３月26日廃止＝株式会社エディオンに株式移転） |
| 株式会社エンプラス | |
| 株式会社オービック | |
| 株式会社コナカ | |
| 近畿通信建設株式会社 | （2010年９月28日廃止＝株式会社ミライト・ホールディングスに株式移転） |
| 株式会社シスメックス | |
| 内外衣料製品株式会社 | （2009年９月16日廃止＝自己破産申し立て） |
| ゼリア新薬工業株式会社 | |
| 株式会社トミー | |
| デンヨー株式会社 | |
| 株式会社ハピネット | |
| 株式会社ベルーナ | |
| 株式会社ホギメディカル | |
| ワタミフードサービス株式会社 | |
| 株式会社ＭＡＲＵＷＡ | |
| 株式会社光栄 | （2009年３月26日廃止＝コーエーテクモホールディングス株式会社に株式移転） |
| ニチメンインフィニティ株式会社 | （2002年７月26日廃止＝ニチメン株式会社と株式交換） |
| 小松ウオール工業株式会社 | |
| 日本システムウエア株式会社 | |
| 日東工器株式会社 | |
| 株式会社昭文社 | |
| 杏林製薬株式会社 | （2006年３月６日廃止＝株式会社キョーリンと株式交換） |
| 株式会社東急コミュニティー | |
| 極東貿易株式会社 | |
| 株式会社丹青社 | |
| 伯東株式会社 | |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 11社 |
| 2000年３月28日 | クラヤ薬品株式会社＝＜合併・株式会社三星堂へ＞ |
| 2000年３月28日 | 株式会社アマダメトレックス＝＜合併・株式会社アマダへ＞ |
| 2000年３月28日 | 株式会社アマダワシノ＝＜合併・株式会社アマダソノイケ＝合併・株式会社アマダへ＞ |
| 2000年３月28日 | 松下冷機株式会社＝＜合併・松下電器産業株式会社へ＞ |
| 2000年３月28日 | 株式会社カンセイ＝＜合併・カルソニック株式会社へ＞ |
| 2000年３月28日 | 三井信託銀行株式会社＝＜合併・中央信託銀行株式会社＝移転・三井トラスト・ホールディングス株式会社へ＞ |
| 2000年３月28日 | 株式会社近畿銀行＝＜合併・株式会社大阪銀行＝移転・株式会社大和銀ホールディングスへ＞ |
| 2000年３月28日 | 加商株式会社＝＜合併・豊田通商株式会社へ＞ |
| 2000年３月28日 | 和光証券株式会社＝＜合併・新日本証券株式会社へ＞ |
| 2000年３月28日 | 第一證券株式会社＝＜合併・ユニバーサル証券株式会社＝合併・三菱証券株式会社へ＞ |
| 2000年３月28日 | 太平洋証券株式会社＝＜合併・ユニバーサル証券株式会社＝合併・三菱証券株式会社へ＞ |
| ■■2000年３月末上場企業■■ | 1403社 |
