| ■上場■ | 2社 |
| ＜2000年９月25日＞ | |
| 株式会社ヤマダ電機 | |
| ＜2000年９月28日＞ | |
| 株式会社みずほホールディングス | （2003年３月６日廃止＝株式会社みずほフィナンシャルグループと株式交換） |
| ■２部から所属変更■ | 15社 |
| ＜2000年９月１日＞ | |
| 株式会社アルゴ二十一 | （2007年10月26日廃止＝キヤノンマーケティングジャパン株式会社と株式交換） |
| アロカ株式会社 | （2011年２月26日廃止＝株式会社日立メディコと株式交換） |
| 株式会社ゴールドクレスト | |
| シンキ株式会社 | （2009年７月５日廃止＝株式会社新生銀行と新生フィナンシャル株式会社が全部取得） |
| 株式会社エムケーシー・スタット | （2010年３月29日廃止＝ＩＴホールディングス株式会社と株式交換） |
| ダイワボウ情報システム株式会社 | （2009年２月24日廃止＝大和紡績株式会社と株式交換） |
| 株式会社葵プロモーション | |
| 日本ビジネスコンピューター株式会社 | |
| 株式会社廣済堂 | |
| 株式会社新川 | |
| 日立ツール株式会社 | |
| 日立エーアイシー株式会社 | （2001年７月26日廃止＝日立化成工業株式会社に株式交換） |
| 日商エレクトロニクス株式会社 | （2009年８月29日廃止＝双日株式会社が全部取得） |
| 東北ミサワホーム株式会社 | （2010年６月15日廃止＝ミサワホーム株式会社と株式交換） |
| 住友不動産販売株式会社 | |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 7社 |
| 2000年９月22日 | 株式会社富士銀行＝＜移転・株式会社みずほホールディングス＝交換・株式会社みずほフィナンシャルグループへ＞ |
| 2000年９月22日 | 株式会社第一勧業銀行＝＜移転・株式会社みずほホールディングス＝交換・株式会社みずほフィナンシャルグループへ＞ |
| 2000年９月22日 | 株式会社日本興業銀行＝＜移転・株式会社みずほホールディングス＝交換・株式会社みずほフィナンシャルグループへ＞ |
| 2000年９月26日 | 東洋エクステリア株式会社＝＜交換・トステム株式会社へ＞ |
| 2000年９月26日 | ケイディディ株式会社＝＜合併・第二電電株式会社へ＞ |
| 2000年９月26日 | 日立電子株式会社＝＜合併・国際電気株式会社へ＞ |
| 2000年９月26日 | 東海丸万証券株式会社＝＜合併・東京証券株式会社へ＞ |
| ■■2000年９月末上場企業■■ | 1427社 |
