| ■上場■ | 4社 |
| ＜2001年３月７日＞ | |
| 株式会社オークワ | |
| ＜2001年３月13日＞ | |
| 伊藤忠食品株式会社 | |
| ＜2001年３月23日＞ | |
| 株式会社ベンチャー・リンク | （2011年５月１日～２部） |
| ＜2001年３月29日＞ | |
| 株式会社日本ユニパックホールディング | |
| ■２部から所属変更■ | 28社 |
| ＜2001年３月１日＞ | |
| アイコム株式会社 | |
| 株式会社井内盛栄堂 | |
| サミー株式会社 | （2004年９月27日廃止＝セガサミーホールディングス株式会社に株式移転） |
| 株式会社ジョイント・コーポレーション | （2009年６月30日廃止＝会社更生法適用申請） |
| テクモ株式会社 | （2009年３月26日廃止＝コーエーテクモホールディングス株式会社に株式移転） |
| シートゥーネットワーク株式会社 | （2003年10月17日廃止＝チェサント･ジャパン･ホールディングス株式会社に株式移転） |
| 株式会社トーメンエレクトロニクス | |
| 株式会社ドウシシャ | |
| 株式会社マクニカ | |
| 株式会社ユニマットライフ | （2010年７月29日廃止＝株式会社ユニマットレインボー及び株式会社ユニマットホールディングが全部取得） |
| 株式会社ヨコオ | |
| リコーリース株式会社 | |
| 焼津水産化学工業株式会社 | |
| 長谷川香料株式会社 | |
| 藤倉化成株式会社 | |
| 前澤化成工業株式会社 | |
| 大豊工業株式会社 | |
| 山一電機株式会社 | |
| 島田理化工業株式会社 | （2009年８月１日～２部） |
| 愛眼株式会社 | |
| 愛三工業株式会社 | |
| 日立ビジネスソリューション株式会社 | |
| 日精樹脂工業株式会社 | |
| 日本ピラー工業株式会社 | |
| 東急リバブル株式会社 | |
| 東京電波株式会社 | （2013年７月29日廃止＝株式会社村田製作所と株式交換） |
| 株式会社松屋フーズ | |
| 丸文株式会社 | |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 15社 |
| 2001年３月23日 | 日本製紙株式会社＝＜移転・株式会社日本ユニパックホールディングへ＞ |
| 2001年３月23日 | 大昭和製紙株式会社＝＜移転・株式会社日本ユニパックホールディングへ＞ |
| 2001年３月27日 | トステムビバ株式会社＝＜合併・トステム株式会社へ＞ |
| 2001年３月27日 | 大和団地株式会社＝＜合併・大和ハウス工業株式会社へ＞ |
| 2001年３月27日 | 株式会社東京三菱銀行＝＜移転・株式会社三菱東京フィナンシャル・グループへ＞ |
| 2001年３月27日 | 三菱信託銀行株式会社＝＜移転・株式会社三菱東京フィナンシャル・グループへ＞ |
| 2001年３月27日 | 日本信託銀行株式会社＝＜移転・株式会社三菱東京フィナンシャル・グループへ＞ |
| 2001年３月27日 | 株式会社三和銀行＝＜移転・株式会社ユーエフジェイホールディングス＝合併・株式会社三菱東京フィナンシャル・グループへ＞ |
| 2001年３月27日 | 株式会社東海銀行＝＜移転・株式会社ユーエフジェイホールディングス＝合併・株式会社三菱東京フィナンシャル・グループへ＞ |
| 2001年３月27日 | 東洋信託銀行株式会社＝＜移転・株式会社ユーエフジェイホールディングス＝合併・株式会社三菱東京フィナンシャル・グループへ＞ |
| 2001年３月27日 | 株式会社さくら銀行＝＜合併・株式会社住友銀行＝移転・株式会社三井住友フィナンシャルグループへ＞ |
| 2001年３月27日 | 株式会社北洋銀行＝＜移転・株式会社札幌北洋ホールディングスへ＞ |
| 2001年３月27日 | 千代田火災海上保険株式会社＝＜合併・大東京火災海上保険株式会社＝交換・三井住友海上グループホールディングス株式会社へ＞ |
| 2001年３月30日 | 昭和アルミニウム株式会社＝＜合併・昭和電工株式会社へ＞ |
| 2001年３月30日 | 興亜火災海上保険株式会社＝＜合併・日本火災海上保険株式会社＝移転・ＮＫＳＪホールディングス株式会社へ＞ |
| ■■2001年３月末上場企業■■ | 1468社 |
